Die VMD-basierten Demonstrationen und die Molekülvibrations -Beispiele aus den Vorlesungen zur Biophysikalischen Chemie sind in den gezippten Skriptsammlungen 'vmdscriptger.zip' und 'viblogfiles.zip' bzw. den entsprechenden *.tar.gz Files enthalten. Die VMD Skripte sind auch mit englischem Text erhältlich. Wenn Sie diese Resourcen nutzen, wäre ich über eine Benachrichtigung dankbar.
VMD Skripte
Sie können die VMD-Skriptesammlung vmdscriptger.zip bzw. .tar.gz hier herunterladen. Diese enthält vor allem Button -kontrollierte Präsentationen, die ein schnelles Umschalten zwischen unterschiedlichen Darstellungen ermöglichen und damit für Vorlesungen und Vorträge besonders geeignet sind. Auch zur Verwendung in einer elearning -Umgebung sind diese buttongesteuerten Darstellungen gut geeignet. Dies gilt im Besonderen für die Hypertext-Buttons, die zu jeder wählbaren Darstellung eine Erläuterung liefern. Die selben Skripte befinden sich auch im Vorlesungsfolder
im Multimediazentrum und auf der CD zur Vorlesung. Zur Verdeutlichung hier einige
Screenshots.
Einige der Skripte sind auch für den Oberstufenunterricht und für die populärwissenschaftliche Vorführungen geeignet. Dabei handelt es sich um Proteine von sehr allgemeinem Interesse wie Antiköroer, Photosynthetische Systeme, Protein des Sehprozesses u.s.w.
Eine Beschreibung mit Hintergrundinformationen über diese Proteine ist auch erhältlich (vmdlehre.pdf) bzw. in Englisch (vmdteach.pdf).
Lesen Sie unbedingt die folgende Installationsanleitung, bevor Sie die gezippten VMD -Beispiel Files verwenden !
Hier erhalten Sie die Skriptfiles, diese sind vom Inhalt her identisch. Bitte laden sie nur das Kompressionsformat herunter, das für Sie am besten geeignet ist:
Die Skripte sind auch mit englischen Erläuterungen erhältlich(hier klicken)
Visualisierung von Schwingungsmoden
Molekülrechnungsresultate (angefertigt mit Gaussian98) für Visualisierungen von Schwingungsmoden mit Molden oder Molekel wie in der Vorlesung 'Biophysikalische Chemie' demonstriert. In der Vorlesung wurde Molden verwendet, da dieses Programm nicht nur die Schwingungsmode Animationen darstellt, aber gleichzeitig auch das Infrarot- bzw. Ramanspektrum.
Hier einige Screenshots.
Zur Verwendung des Chime -Plug-ins finden Sie hier Beispiele. Es besteht auch ein Link zu zusätzlichen externen Seiten . Bei der Installation werden nur einige wenige Browsertypen, wie Netscape 4.7x oder einige Versionen von IE erkannt.
Unter IE funktionieren leider viele Beispiele nicht. Sie können aber den Plugin auch für Mozilla, Firefox und Netscape installieren, siehe hier.
Kontakt:
Peter Schellenberg, tel. (+351) 253-604074
